Сборы И.И.Лепехина хранятся в Гербариях: LE, B.Этапы профессионального пути:1760 студент Академического университета в Петербурге 1762 13 сентября был послан в Страсбургский университет с наставлением обучаться натуральной истории, а также немецким и французским языкам. 1767 по возвращении в Петербург в октябре Лепехин был аттестован С.Г.Гмелиным (младшим) и П.С.Палласом на звание адьюнкта АН 1768 23 маяприсвоенно звание адьюнкта АН. 1774-1802 занимал должность директора Ботанического сада АН.

Сын однодворца, солдата Семеновского полка. По прошению отца принят в Академическую гимназию; c 1760 - студент Академического университета. 13 сентября 1762 г. был послан в Страсбургский университет с наставлением обучаться натуральной истории, а также немецким и французским языкам.Когда в АН в 1764 г. обсуждался вопрос о приглашении профессора ботаники из числа европейских ученых, М.В.Ломоносов, желая сохранить эту должность для природного россиянина, предложил продлить срок пребывания Лепехина за рубежом для усовершенствования образования, "и потому указать ему упражняться паче всех в ботанике еще два года, а в третий определить на путешествия, чтобы видеть в других государствах славные ботанические сады и ботаников" (Лукина, 1965: 17). Поэтому Лепехин посвящал изучению растений особенно много времени: - "Хотя еще ботаническая коллекция не началася, однако я уже недели с четыре в свободное время хожу на поля для эксаминования (т.е. определения - А.С.) и собирания трав, имея предводителем систему натуры г. Линнея" - писал Лепехин в АН.

Успешно изучая естественные науки и медицину, Лепехин работал в ботаническом саду профессора Шпильмана, а в свободное время уходил из города в поле, собирая и определяя растения. В 1765 г. Лепехин пишет небольшую работу "Plantae Alsaticae, quae in flora Ingrica non inveniuntur" (Эльзасские растения, которые отсутствуют во флоре Ингрии). Она написана в феврале 1765 г. и представлена Академическому собранию 13 июня 1765 г. В наивном студенческом исследовании проявляется зачаток метода сравнительной флористики. Рукопись хранится в Санкт-Петербургском филиале архива РАН (ПФА РАН. Ф. 1. Оп. 2-1765, N. 6).
По возвращении Лепехина в Петербург в октябре 1767 г. ему предстоял экзамен. Аттестация была поручена С.Г.Гмелину (младшему) и П.С.Палласу. Им предлагалось "ласковым и пристойным образом"освидетельствовать знания молодого доктора с дипломом Страсбургского университета и "представить Комиссии об успехах его свое мнение". Однако, они "словесно объявили, что пристойнее ему препоручить сделать описания некоторых натуральных вещей, взятых из Кунсткамеры, кои и представили, а именно: пять банок с различными животными, три птицы и несколько трав" (Сухомлинов, 1875 : 195). Экзаменационная работа Лепехина заслужила общее одобрение и он был единогласно избран адъюнктом 23 мая 1768 г.
С 1774 г. стал директором Ботанического сада АН, который возглавлял до самой смерти.

Лепехин перевел и прокомментировал "Всеобщую и частную естественную историю" Ж.-Л.-Л.Бюффона (1789-1790) (совместно с С.Я.Румовским, Н.П.Соколовым и др.). С момента образования Российской АН (1783), Лепехин стал ее непременным секретарем и переводчиком, а также участником "Словаря Академии Российской" (Т. 1-6; 1789-1794). В нем он успешно разрабатывал русскую ботаническую терминологию.